光緒《黃巖縣志》卷一：“土鼓嶼，在縣南十二里，狀如覆缶，登者以足踢之，則有聲如鼓。”清時屬南城都1～2圖，鼓嶼鄉(xiāng)25都1～3圖，50都1圖。

1947年分屬城南鎮(zhèn)、院橋區(qū)鼓嶼鎮(zhèn)。

1949年5月設(shè)立鼓嶼鄉(xiāng)。

1956年，羽山鄉(xiāng)的蔡家洋、民建村，藥山鄉(xiāng)的橫山頭、藥山、下洋山、魚沉、金寺堂、吉岙楊村并入鼓嶼鄉(xiāng)。

1958年稱鼓嶼管理區(qū)。

1961年為鼓嶼人民公社，屬澄江區(qū)。

1983年復(fù)為鼓嶼鄉(xiāng)。

1992年設(shè)城關(guān)鎮(zhèn)南城辦事處。

2001年撤銷城關(guān)鎮(zhèn)，設(shè)南城街道辦事處。