1950年屬邵甸區(qū)彩云鄉(xiāng)。

1951年5月與今侯家營(yíng)村委會(huì)轄區(qū)合設(shè)高倉(cāng)鄉(xiāng)。

1952年8月更名馬軍鄉(xiāng)。

1954年4月并入阿子營(yíng)鄉(xiāng)，屬邵甸區(qū)。

1958年10月設(shè)立馬軍管理區(qū)。

1961年月改稱馬軍生產(chǎn)大隊(duì)，屬阿子營(yíng)人民公社。

1963年3月，撤銷(xiāo)大隊(duì)，與原高倉(cāng)大隊(duì)合設(shè)馬軍（小）公社，屬阿子營(yíng)區(qū)。

1966年7月，高倉(cāng)（侯家營(yíng)）、馬軍分設(shè)大隊(duì)。

1984年3月改設(shè)馬軍鄉(xiāng)，屬阿子營(yíng)區(qū)。

1987年1月改設(shè)馬軍辦事處。

2000年11月改設(shè)馬軍村民委員會(huì)，屬阿子營(yíng)鄉(xiāng)。

2009年6月屬阿子營(yíng)鎮(zhèn)。

2011年3月起屬阿子營(yíng)街道。