清乾隆年間（1736-1795），轄區(qū)歸烏里雅蘇臺定邊左副將軍屬下的科布多參贊大臣管轄，哈薩克克烈，乃蠻等部落遷居于此地。

光緒三十一年（1905），科布多與阿爾泰分治，屬阿爾泰辦事大臣管轄。

1914年，設(shè)置布爾津縣佐。

1919年4月，隸屬阿山道；7月24日，設(shè)布爾津縣。

1950年，隸屬阿山專區(qū)。

1954年，隸屬伊犁哈薩克自治州阿勒泰專區(qū)。

1970年，隸屬伊犁哈薩克自治州阿勒泰地區(qū)。

1980年，縣轄1鎮(zhèn)、3公社、1林場、2牧場。

1984年，2個牧場改建為鄉(xiāng)，新建禾木喀納斯蒙古族鄉(xiāng)，縣轄1鎮(zhèn)6鄉(xiāng)。