民國時期，屬東升鄉(xiāng)第二保。

1951年，建政為鹽井鄉(xiāng)第五村。

1955年，建社為鹽井鄉(xiāng)五村新華社。

1958年，為衛(wèi)星公社四十八管理區(qū)。

1962年，為東升公社上游大隊。

1967年，為東升公社五大隊。

1972年，仍為東升公社五大隊。

1981年，地名普查命名為東升公社三官大隊，1984年，公社改鄉(xiāng)時改為東升鄉(xiāng)三官村。

1992年，撤區(qū)并鄉(xiāng)建鎮(zhèn)時名為東升鎮(zhèn)三官村。

2020年，村級建制調(diào)整，撤銷檬子村和三官村，合并設立三官村（營府函〔2020〕72號）。