畖底、薛店、、陽隅俗稱北垣。

1943年，設(shè)立稷麓縣，北垣西部劃歸稷麓二區(qū)。

1945年，畖底屬絳南縣，1947年，屬五區(qū)政府，設(shè)四區(qū)民主政府西畖底行政村。

1948年10月，絳南縣撤銷，北垣劃歸聞喜。

1949年10月，五區(qū)轄現(xiàn)畖底鎮(zhèn)、薛店鎮(zhèn)、陽隅鄉(xiāng)，慣稱為北垣四十八個(gè)村。

1953年，設(shè)五區(qū)人民政府西畖底行政村，分屬五區(qū)東顏、西畖底、栗村、東雷陽、回坑、陽隅。

1954年，區(qū)級(jí)機(jī)構(gòu)撤銷，北垣八個(gè)鄉(xiāng)合并為畖底、薛店兩個(gè)鄉(xiāng)。

1958年，東畖底、中畖底、西畖底屬北垣人民公社。

1961年，畖底從北垣公社劃出，成立畖底人民公社。

1984年，根據(jù)省政府（84）晉政函79號(hào)文，更名為畖底鎮(zhèn)。