1962年偏關(guān)縣設(shè)15個人民公社，南溝生產(chǎn)大隊隸屬于南堡子公社。

1984年9月，偏關(guān)縣撤銷人民公社，建立鄉(xiāng)鎮(zhèn)人民政府，生產(chǎn)大隊改為行政村，南溝生產(chǎn)大隊改名南溝村民委員會。

2001年偏關(guān)縣并為10個鄉(xiāng)鎮(zhèn)，南溝村民委員會隸屬于南堡子鄉(xiāng)。

2020年5月，全縣“并村簡干”，撤銷車道坡村民委員會，并入南溝村民委員會。

2021年1月，偏關(guān)縣撤鄉(xiāng)設(shè)鎮(zhèn)，撤銷南堡子鄉(xiāng)和尚峪鄉(xiāng)，合并設(shè)立尚峪鎮(zhèn)，南溝村民委員會隸屬于尚峪鎮(zhèn)。