夏時，屬青州。

商時，為萊國地。

周時，境域有襸、密、邶殿、都昌和棠鄉(xiāng)。

秦時，置都昌縣，屬膠東郡。

漢時，增平城、膠陽、下密。

唐初，置訾亭、華池、膠東、平城和下密5縣，不久皆撤銷，歸入北�？h。

宋建隆三年（962），由青州北�？h析唐安鄉(xiāng)置昌邑縣；乾德三年（965），改屬濰州。

元時，屬山東東西道宣慰司益都路總管府濰州。

明初，屬青州府，洪武十年（1377年），撤銷昌邑歸濰縣；二十二年（1389年），恢復昌邑縣，改屬萊州府平度州，在北部濱海設漁兒鎮(zhèn)（今漁爾堡）巡檢司。

清初，屬萊州府平度州，雍正十二年（1734），改屬萊州府。

1913年屬膠東道。

1925年屬膠萊道。

1928年直屬山東省。

1938年屬第八行政督察區(qū)。

1939年后，屬第十三行政督察區(qū)。

1945年，改屬第十七行政督察區(qū)。

1941年，抗日民主政權昌邑縣人民政府在瓦城成立，轄縣境北部地區(qū)，屬膠東區(qū)西海專區(qū)；1942年7月，改屬清河區(qū)清東專區(qū)；1944年，屬渤海區(qū)第五專區(qū)。

1944年5月，與濰北縣合并稱昌濰縣，屬渤海區(qū)第五專區(qū)。

1945年6月，復分，改屬膠東區(qū)西海專區(qū)。

1945年8月，原昌邑第十區(qū)即宋莊及其以南地區(qū)劃入平度和高密，隨后又分置，初為昌南行署，10月改建昌南縣，屬西海專區(qū)。

1948年秋，政府機構由馬渠移駐縣城。

1950年5月，昌邑、昌南2縣改屬昌濰專區(qū)（昌濰地區(qū)、濰坊地區(qū)、濰坊市）。

1956年4月，昌南縣并入昌邑縣。

1994年6月，撤銷昌邑縣，改設縣級昌邑市。