明代屬瑞昌縣金城鄉(xiāng)。

清名金一、金二鄉(xiāng)。

1912年屬下北鄉(xiāng)，后改為區(qū)。

1938年秋，日軍侵占碼頭，更名為泥灣鎮(zhèn)。

1945年后，泥灣鎮(zhèn)改名碼頭鎮(zhèn)，駐地碼頭街。

1950年元月，屬瑞昌縣碼頭區(qū)，下設(shè)9個(gè)小鄉(xiāng)。

1957年，合并為碼頭、黃嶺、武蛟3個(gè)鄉(xiāng)。

1958年9月，成立碼頭人民公社，范圍包括碼頭和黃嶺。

1972年，黃嶺劃出，仍名碼頭公社。

1984年3月，公社改為鎮(zhèn)。

2007年11月，原流莊鄉(xiāng)整體并入碼頭鎮(zhèn)。