1949年民主建政后，設(shè)立木瓜園行政村，負責(zé)人稱村長；1958年實行人民公社建制，實行生產(chǎn)資料分別歸公社、生產(chǎn)大隊、生產(chǎn)隊三級組織所有的體制；設(shè)立紅旗生產(chǎn)大隊管理委員會，簡稱紅旗生產(chǎn)大隊、紅旗大隊，負責(zé)人稱大隊長；1959年5月，以駐地命名，更名為木瓜園產(chǎn)大隊管理委員會；1966年5月，我國“文化大革命”開始，更名為紅旗生產(chǎn)大隊革命委員會，負責(zé)人稱主任；從1978年11月黨的十一屆三中全會開始，對我國“文化大革命”的錯誤進行撥亂反正；1980年，復(fù)名紅旗生產(chǎn)大隊管理委員會。

1984年5月，實行農(nóng)村體制改革，撤社并區(qū)建鄉(xiāng)，政社分開，撤銷紅旗生產(chǎn)大隊管理委員會，選舉產(chǎn)生木瓜園村民委員會，簡稱木瓜園村委會，負責(zé)人稱主任；2001年小村并大村，屬原建制村；轄6個村民小組。