明代建村。

1958年稱萬古人民公社東妹大隊、中妹大隊、西妹大隊。

1968年設置東妹大隊革委會、中妹大隊革委會、西妹大隊革委會。

1979年恢復東妹大隊、中妹大隊、西妹大隊。

1983年稱萬古鄉(xiāng)東妹村民委員會、中妹村民委員會、西妹村民委員會。

1988年地名標準化后，稱萬古鄉(xiāng)妹村東街村民委員會、妹村中街村民委員會、妹村西街村民委員會。

1996年稱萬古鎮(zhèn)妹村東街村民委員會、妹村中街村民委員會、妹村西街村民委員會。

2020年，村居規(guī)模調(diào)整，東妹村、中妹村、西妹村、袁莊4個村合并調(diào)整為妹村村民委員會，仍屬萬古鎮(zhèn)。