訥南村，原名“官貨店”。

清宣統(tǒng)二年（1910），以官款由湖北移民建立“湖北墾民”7屯，名為“官貨店”，隸屬訥河直隸廳管轄。

1913年由山東移民于官貨店西建屯開荒，取名山東頭屯，后改為“魯民屯”，隸屬訥河縣第二區(qū)管轄。

東北淪陷后，初設(shè)訥南鎮(zhèn)，隸屬訥南鎮(zhèn)區(qū)管轄。

1938年1月改設(shè)訥南村。

1946年4月設(shè)置訥南區(qū)，1948年改為第六區(qū)，1955年5月復(fù)改訥南區(qū)。

1956年4月，撤區(qū)劃鄉(xiāng)，分設(shè)訥南、魯民、興業(yè)、巨和4個鄉(xiāng)。

1958年9月，將4個鄉(xiāng)合并成立訥南人民公社。

1966年8月，將南部地區(qū)劃出設(shè)置巨和公社。

1984年4月，將訥南公社改為訥南鄉(xiāng)，同年11月改為訥南鎮(zhèn)。

2008年4月，撤銷訥河鎮(zhèn)，將訥河鎮(zhèn)管轄3個行政村劃入訥南鎮(zhèn)。

名稱沿用至今。