明代時期，黑土鎮(zhèn)境域屬朵你則溪。

清代時期，屬太平里八甲。

民國初期，屬南區(qū)。

民國三十三年（1932年），設黑土鎮(zhèn)，屬六區(qū)。

民國二十四年（1935年），屬四區(qū)蒙梭聯(lián)保八保。

民國三十三年（1944年），屬嶺南鄉(xiāng)。

1950年1月，屬五區(qū)；同年6月，屬八區(qū)。

1952年2月，設鄉(xiāng)，屬十二區(qū)。

1958年9月，成立設公社。

1959年1月，改為管理區(qū)。

1961年8月，恢復為公社。

1967年12月，成立革命委員會。

1992年1月，為黑土鄉(xiāng)。

2016年，撤銷黑土鄉(xiāng)，設置黑土鎮(zhèn)。