元代時(shí)期，三棵樹(shù)鎮(zhèn)境域?qū)俨ブ菪克尽?/p>
明、清時(shí)期，屬清平縣。
民國(guó)二年（1913年），置爐山縣第二區(qū)第三分區(qū)。
民國(guó)二十一年（1932年），置爐山縣第三區(qū)五丁鎮(zhèn)、鉛廠鎮(zhèn)、格致鄉(xiāng)和第四區(qū)平樂(lè)鎮(zhèn)、平江鄉(xiāng)、計(jì)高鄉(xiāng)、白蛇鄉(xiāng)。
民國(guó)二十五年（1936年），置開(kāi)懷聯(lián)保和掛丁聯(lián)保。
民國(guó)三十年（1941年），推行新縣制，置悅平鄉(xiāng)和化鉛鄉(xiāng)。
1953年，置烏燒、平樂(lè)、平寨、格細(xì)、朗利、掛丁、洞下、鉛廠、板溪9鄉(xiāng)。
1956年，縮并為平樂(lè)、平寨、格細(xì)、掛丁、鉛廠、板溪6鄉(xiāng)。
1958年，成立勝利公社和悅平公社。
1961年，置掛丁、格沖、平樂(lè)3公社。
1984年5月，設(shè)掛丁鎮(zhèn)、格沖鄉(xiāng)、平樂(lè)鄉(xiāng)。
1992年1月，格沖鄉(xiāng)并入掛丁鎮(zhèn)，平樂(lè)鄉(xiāng)并入開(kāi)懷鄉(xiāng)。
1995年7月，掛丁鎮(zhèn)、開(kāi)懷鄉(xiāng)合并為三棵樹(shù)鎮(zhèn)。
2010年8月5日，三棵樹(shù)鎮(zhèn)中的棉席、塘寨、黨果、開(kāi)懷、悅來(lái)堡、蒿支坪、龍井、寨瓦、養(yǎng)朵、掛丁10村析出置開(kāi)懷街道，三棵樹(shù)鎮(zhèn)建制保留。