石正原名“石窟”，原屬程鄉(xiāng)縣（今梅縣），明嘉靖四十三年（1564年）改屬平遠縣至今。

明崇禎七年（1634年）石窟都改名為石正都。

清康熙二十二年（1683年）廢都、堡建置，平遠設(shè)15個鄉(xiāng)，石正屬其中一個鄉(xiāng)，并一直保持到清末。

民國期間，石正先后劃為平遠縣第六區(qū)、第三區(qū)和石正鄉(xiāng)。

1949年5月，平遠解放后，石正屬第七區(qū)，轄7個村。

1950年3月，石正改屬第四區(qū)。

1952年6月，平遠、蕉嶺合縣時，石正屬蕉嶺第八區(qū)；1954年3月，平、蕉分縣后，石正屬平遠縣大柘區(qū)。

1956年12月，設(shè)立石正鄉(xiāng)。

1958年9月，石正鄉(xiāng)屬大柘人民公社。

1961年1月，石正和大柘分為兩個公社。

1983年12月，恢復(fù)區(qū)鄉(xiāng)建制。

1986年11月，撤區(qū)建鎮(zhèn)。

1999年3月，石正鎮(zhèn)撤管理區(qū)辦事處。