斗頂村的建制沿著時代發(fā)展不斷變革，唐時隸屬于閩縣寧基里。

宋、元至明代中葉屬懷安縣。

明代下葉和清代歸屬侯官縣。

清末，屬侯官縣富村區(qū)。

民國時期，屬閩侯（林森）縣五區(qū)（新店區(qū)）。

中華人民共和國成立后，1949年12月屬福州市洪山區(qū)勝華鄉(xiāng)。

1955年9月屬戰(zhàn)坂鄉(xiāng)。

1961年稱斗頂大隊，屬戰(zhàn)坂大隊。

1978年稱斗頂大隊，屬環(huán)城區(qū)新店公社。

1984年稱斗頂村設(shè)立村民委員會，屬郊區(qū)新店鄉(xiāng)。

1992年稱斗頂村，屬郊區(qū)新店鎮(zhèn)；1995年稱斗頂村，屬晉安區(qū)新店鎮(zhèn)。