明清時期設(shè)水南都。

1931年—1934年設(shè)水南區(qū)蘇維埃政府。

1934年水南都改保，設(shè)水南、谿南保，為第一區(qū)署駐地，屬桃溪聯(lián)保，1939年屬古鏞鎮(zhèn)。

1950年3月設(shè)新南鄉(xiāng)，屬第一區(qū)（城關(guān)）。

1952年8月，新南鄉(xiāng)改名水南鄉(xiāng)。

1958年10月，水南鄉(xiāng)改大隊(duì)，屬紅星（城關(guān)）公社。

1959年12月，設(shè)水南綜合農(nóng)場，轄6個管區(qū)。

1970年11月，與城關(guān)公社合并為水南公社。

1979年6月，改水南綜合農(nóng)場。

1998年1月，改為水南鎮(zhèn)。