明嘉靖四十四年（1565年），蔡伯貫組織白蓮教在萬古場起兵，定都萬古場。

清前期，屬福元里。

清宣統(tǒng)元年（1909年），重置萬古鎮(zhèn)（置萬古場），析置大堡鄉(xiāng)、雍溪鄉(xiāng)。

民國元年（1912年），萬古鎮(zhèn)析置協(xié)和鄉(xiāng)、興隆鄉(xiāng)。

民國十九年（1930年），為第三區(qū)。

民國二十四年（1935年），為聯保區(qū)，設萬古為第三聯保區(qū)。

民國三十一年（1942年），改萬古為第二區(qū)。

1949年，改萬古為第六區(qū)。

1950年，萬古鎮(zhèn)屬第六區(qū)（治萬古鎮(zhèn)）。

1952年，劃出回龍仍設第六區(qū)。

1953年2月，改為萬古鎮(zhèn)。

1956年9月，萬古鎮(zhèn)改為萬古鄉(xiāng)，中心鄉(xiāng)并入，次年以街村為鎮(zhèn)。

1993年12月，撤萬古鄉(xiāng)設萬古鎮(zhèn)，高峰鄉(xiāng)、新石鄉(xiāng)、石牛鄉(xiāng)并入萬古鎮(zhèn)。