現(xiàn)上莊地域歷史上長期隸屬于昌平縣。

西郊農(nóng)場前身彰化農(nóng)場系1949年11月建立，場部設(shè)在彰化村（今四季青南部），1954年4月改為現(xiàn)名。

1956年3月，白水洼鄉(xiāng)成立。

1958年5月，西郊農(nóng)場場部遷至上莊村村南（屬白水洼鄉(xiāng)）。

1958年9月1日，現(xiàn)鄉(xiāng)域并入昌平區(qū)先鋒人民公社。

10月，原白水洼鄉(xiāng)大部（除東坨）、蘇家坨鄉(xiāng)等地劃歸海淀區(qū)，并入10月7日新成立的海淀區(qū)永豐人民公社。

1961年4月，永豐公社撤銷，在現(xiàn)鄉(xiāng)域成立上莊人民公社。

與國營西郊農(nóng)場實行場鄉(xiāng)合一的行政體制。

1984年4月4日，上莊公社改鄉(xiāng)，鄉(xiāng)政府與西郊農(nóng)場合署辦公。

1998年11月，鄉(xiāng)與農(nóng)場分離。

2003年8月，撤上莊鄉(xiāng)設(shè)立上莊鎮(zhèn)。