夏末商初，商王湯于境內(nèi)建都，稱亳。
周初，境內(nèi)始稱焦，周武王封神農(nóng)氏后裔于焦，置焦國。
周景王十七年（前528）楚平王筑譙城改焦為譙，境內(nèi)始稱譙。
秦王政二十四年（前223）秦滅楚，在當(dāng)?shù)刂米S縣，隸泗水郡。
西漢至東漢，名稱未變。
東漢建武十八年（42），豫州刺史治于譙縣。
建安末年置譙郡，治于譙縣。
魏黃初二年(221）改譙為都。
晉稱譙國，都譙縣。
東晉咸康四年(338）晉于譙縣僑置陳留郡小黃縣，自此譙縣又稱小黃縣。
北魏正始四年(507），置南兗州，治小黃縣。
北周大象元年(579），因當(dāng)?shù)毓艦樯虦汲�，改南兗州為亳州�?/p>
隋大業(yè)三年（607），改小黃縣為譙縣，一直沿用至元朝。
明，洪武初，廢譙縣，城父縣，并入亳州。
洪武六年（1373），改亳州為亳縣，隸鳳陽府潁州。
弘治九年(1496），改亳縣為亳州，隸鳳陽府。
清代，當(dāng)?shù)匾恢狈Q亳州。
1912年，亳州改為亳縣。
新中國成立后，稱亳縣。
1986年3月國務(wù)院批準(zhǔn)撤銷亳縣，建立亳州市（縣級(jí)）。
1996年經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn)為省直管市。
1998年收歸省直轄。
2000年6月組建地級(jí)亳州市，原亳州市整建制轉(zhuǎn)化為譙城區(qū)。
2006年譙城區(qū)鄉(xiāng)鎮(zhèn)區(qū)劃調(diào)整，區(qū)劃調(diào)整后的譙城區(qū)轄3個(gè)街道、20個(gè)鎮(zhèn)、2個(gè)鄉(xiāng)。
地名沿用至今。